Ce laboratoire sert notamment à la réalisation de travaux de recherche portant sur la compréhension du devenir environnemental des matériaux énergétiques. Le laboratoire comprend deux bacs expérimentaux dont la taille permet de réaliser des expériences de restauration se rapprochant des conditions de terrain, mais sous des conditions expérimentales contrôlées. Ces bacs peuvent contenir de 4 à 9 m³ de sols provenant de sites contaminés ou de sols propres auxquels des contaminants spécifiques peuvent être ajoutés.
Le Laboratoire de bio-optique et biogéochimie aquatique permet d’effectuer des recherches sur les effets des changements climatiques et du dégel du pergélisol sur la dynamique de mélange et la transparence de l’eau en milieu lacustre, et leurs multiples conséquences sur le réseau alimentaire microbien, les émissions de gaz à effet de serre et l’habitat oxythermique. Les recherches effectuées avec cette infrastructure portent également sur le développement d’outils optiques pour la détection précoce des fleurs d’eau d’algues et de cyanobactéries et autres problématiques liées au brunissement des eaux.
Ce laboratoire pilote offre à la communauté scientifique et à l’industrie son expertise multidisciplinaire et ses équipements de pointe pour le développement et la mise à l'échelle de procédés de fermentation ainsi que la récupération, la purification et la caractérisation de divers dérivés microbiens. Sa vocation première est la R&D dans le domaine des biotechnologies, et tout spécialement les produits à valeur ajoutée utilisant des résidus putrescibles comme matière première.
Le laboratoire est doté d’un cytomètre BD LSRFortessa à quatre lasers qui permet d'effectuer des analyses multiparamétriques de haut niveau pour caractériser des populations cellulaires. Un cytomètre BD FACS Calibur à deux lasers permet d’effectuer des analyses de routine telle l’expression de marqueurs de surface. Le système de microscopie confocale Zeiss LSM780 est quant à lui un instrument de pointe permettant l’étude de divers processus biologiques sur plans cellulaire et subcellulaire tels le « trafficking » intracellulaire et la localisation de molécules d’agents pathogènes.
Le laboratoire MiCEL se spécialise dans l’analyse moléculaire et métagénomique des communautés microbiennes présentes dans les infrastructures de gestion de l’eau.
Le laboratoire est capable de performer différentes analyses utilisant l’ADN et l’ARN présent dans les échantillons environnementaux incluant : l'exercice d'analyses et quantifications PCR (réaction de polymérisation en chaîne), la microscopie en fluorescence in situ Hybridization de l'ARN 16S (FISH), le séquençage à haut débit d’amplicons pour analyser la diversité phylogénétique et fonctionnelle des communautés, ainsi que le séquençage métagénomique (shotgun sequencing).
Ces laboratoires permettent d’analyser des échantillons d’eau par colorimétrie, fluorométrie, spectroscopie, radioisotopie et chromatographie, ainsi que d’analyser les composés organiques et les métaux traces présents dans différentes matrices (eau, effluents, boues d’épuration, sols, sédiments, tissus biologiques), et enfin, d’analyser les éléments présents dans des échantillons solides (roches, sols, sédiments, boues). Scanographie par microfluorescence X : Analyses non destructives par radiographie couplées à l’analyse chimique par microfluorescence X de roches, de sols et de sédiments. Microscopie électronique à balayage : Production d’images en haute résolution de la surface et de la composition d’un échantillon à l’aide d’une technologie utilisant les interactions électrons-matière.
